Гострі кишкові інфекції (Shigella, ЕIEC, Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Astrovirus, Norovirus G2), якісне визначення ДНК методом ПЛР

Гострі кишкові інфекції - група захворювань, зумовлених вірусами, бактеріями чи паразитами, котрим характерний фекально-оральний механізм передачі. Спільними для цих інфекцій є фактори передачі: харчові продукти, вода, інфіковані побутові предмети та брудні руки. Перші симптоми виникають через кілька годин або днів після інфікування, початок різкий, з появою частого рідкого випорожнення, блювання, біль у животі, ознак інтоксикації (лихоманки, ознобу, нудоти). Захворювання може мати груповий характер і проявитися у кількох людей, які вживали інфіковану їжу чи воду.

Shigella species та Esherichia coli (EIEC) – грамнегативні паличкоподібні мікроорганізми із сімейства ентеробактерій. Бактерії роду Salmonella належать до сімейства ентеробактерій. Існує безліч сероваріантів Salmonella species, здатних викликати у людини інфекцію на кшталт гастроентероколіту, а також стати причиною внутрішньолікарняних інфекцій. Кампілобактерії є одними з найбільш складних для культивування (яке потрібно в ході аналізу) мікроорганізмів. Це пояснюється їх мікроаерофільністю і можливістю придушення їх зростання супутньої флорою. Норовірус – найчастіший збудник спалахів ГКІ небактеріальної етіології. Ця особливість пов'язана з низькою дозою, що інфікує, і високою стійкістю в навколишньому середовищі. Астровіруси в порівнянні з ротавірусами і норовірусами мають дещо меншу поширеність, складають значний пласт кишкових інфекцій, у третини пацієнтів - з проявами коліту. Ротавіруси групи А є найчастішою причиною спорадичних захворювань ГКІ у дітей, а ДНК, що містить аденовірус F (серотипи 40 і 41), нерідко викликає спалахи гастроентеритів у дітей молодшого віку.

Метод ПЛР дозволяє виявити у біологічному матеріалі (у калі) фрагменти генетичного матеріалу (ДНК) збудника інфекції. ПЛР характеризується дуже високою чутливістю (93-95%).

Кал

Перед здачею досліджень необхідно узгодити з лікуючим лікарем прийом і скасування  препаратів.
При контролі лабораторних показників у динаміці рекомендується проводити лабораторні дослідження за однакових умов: здавати кал в одній лабораторії, в однаковий час доби, тощо.
Про прийом лікарських препаратів необхідно повідомити співробітників у відділенні.
Дане дослідження оформлюється тільки з приносного біоматеріалу.

Правила взяття біологічного матеріалу

• Для дослідження збирають свіжевиділений кал. Перед збором необхідно помочитись (для виключення можливості потрапляння сечі у фекальні маси).
• При зборі біоматеріалу необхідно уникати контамінації біологічного матеріалу сторонньою мікрофлорою (ретельно мити руки до взяття, використовувати тільки стерильні витратні матеріали та ін.).
• Кал збирається в стерильний одноразовий контейнер спеціальною ложечкою в кількості не менше 50г (обсяг від чайної до столової ложки) і не більше, ніж 1/3 об'єму стерильної ємності (якщо при зборі матеріалу використовують судно, то його попередньо необхідно обробити дез.засобом, а після обробити окропом, щоб видалити сліди дез.засоба).
• На дослідження набираеться середня порція калових мас. Перша порція, або калова пробка, на дослідження не набирається.
  

Для немовлят:

• Допустимо проводити відбір матеріалу з середньої частини фекальних мас ложкою, не торкаючись памперса. 
• Нeвелику частину 1.0-3.0 г (1.0-3.0 мл) збирають з 7-10 різних місць ложечкою контейнера або іншим стерильним предметом. 
• Заборонено використовувати ректальні свічки.

Перед збором матеріалу необхідно:

За 1-3 дні до взяття матеріалу виключити з раціону прийом продуктів, що підсилюють процеси бродіння у кишечнику, молочнокислі продукти, алкоголь.

Не слід здавати:

• Кал, отриманий після клізми, а також після прийому барію (при рентгенологічному обстеженні).
• Жінкам не рекомендується здавати аналіз калу під час менструації. 

За 3-4 дні до дослідження рекомендовано скасувати:

• прийом проносних препаратів, касторового і вазелінового масла;
• припинити введення ректальних свічок;
• виключити прийом препаратів, які можуть забарвлювати кал (залізо, вісмут)
• виключити прийом препаратів, які посилюють перистальтику кишечника.
  

Взяття матеріалу здійснюється до початку антибактеріального і антимікробного лікування (загального і місцевого значення), або через 2-3 тижні після відміни цих препаратів.
Важливо! Скасування або прийом лікарських препаратів обговорюється з лікарем в кожному індивідуальному випадку.  

Спеціальні умови зберігання біологічного матеріалу:

• Для м.Одеси – біологічний матеріал, набраний у стерильну ємність, необхідно доставити у відділення лабораторії протягом 1-2 годин після дефекації. При неможливості доставити матеріал протягом цього часу до відділень м.Одеси, транспортний контейнер необхідно зберігати в холодильнику при температурі +2…+8°С, але не більше 10-12 годин.
• Для інших міст необхідно доставити ранковий кал, набраний у стерильну ємність, протягом 1-2 годин після дефекації.
  

Транспортний контейнер - стерільний пластиковий стаканчик з ложкою і кришкою. на контейнері необхідно вказати ПІБ пацієнта, а також дату і час збору матеріалу.
Неприпустимо приносити кал на дослідження в сірникових або картонних коробках, так як при цьому змінюються форма і консистенція калу, що впливає на результати аналізу. 

АНАЛІЗАТОР:

РЕФЕРЕНСИ:

ПРИ ЗНИЖЕННІ:

відсутність збудника ГКІ в біоматеріалі: етіологія залежно від виявленого виду збудника (Shigella, E. coli (EIEC), Salmonella, Campylobacter, Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus G 2, Astrovirus). 

ПРИ ПІДВИЩЕННІ:

наявність збудника ГКІ в біоматеріалі: етіологія залежно від виявленого виду збудника (Shigella, E. coli (EIEC), Salmonella, Campylobacter, Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus G 2, Astrovirus). 

ІНТЕРФЕРЕНЦІЯ

ПІДВИЩЕННЯ:

ЗНИЖЕННЯ:

показання до призначення:

• встановлення етіологічного фактора гострої кишкової інфекції;
• диференціальна діагностика причин гострого гастроентероколіту.